Todas as ações de vigilância, prevenção e controle de doenças estão reunidas numa única estrutura do Ministério da Saúde, a Secretaria de Vigilância em Saúde - SVS. As atividades da Secretaria incluem a coordenação nacional de programas relevantes como os de prevenção e controle das doenças sexualmente transmissíveis e aids, da dengue, malária, hepatites virais, hanseníase e da tuberculose, entre outras; o Programa Nacional de Imunizações (PNI); a investigação e resposta aos surtos de doenças de relevância nacional; e a coordenação da rede nacional de laboratórios de saúde pública.