O Museu Histórico de São Francisco do Sul caracteriza-se pela sua edificação antiga e por ter abrigado uma antiga prisão, no final do século XVIII.
O acervo conta com objetos, documentos, plantas, jornais e utensílios domésticos.
No pátio exterior do prédio encontram-se expostos moinhos de cana e mandioca e uma máquina utilizada na fabricação de telhas.