Para dar suporte ao desenvolvimento do esporte amador em Santa Catarina, a Fundação possui um tratamento diferenciado para atletas profissionais e amadores.Conta com uma vasta área, onde se situa a Casa do Desporto, complexo formado pela sede da Fundação, Federações Desportivas, Conselho Estadual de Desporto e Tribunal de Justiça Desportiva. Em parceria com as prefeituras municipais, federações esportivas e entidades de classe, envolve mais de 300 mil atletas, com idade a partir de 10 anos. Além de uma equipe administrativa, com uma equipe técnica ligada à diretoria de desporto, dividindo-se em três áreas gerenciais: Desporto de Rendimento, Desporto de Participação e Desporto Educacional. É responsável, ainda, pela organização e acompanhamento de delegações catarinenses que participam todos os anos de competições nacionais fora do Estado, como a Olimpíada Escolar JEBS e Jogos Abertos Brasileiros. A fundação acompanha também a delegação catarinense que participa dos Jogos da Juventude Italiana, realizado na Itália.